Michael je ponovo zatvoren, ali sada u SONA (Panama), zajedno sa T-Bagom, Mahoneom i Bellickom. U zatvoru vladaju isključivo zatvorenici, čiji se lokalni zatvor-gospodar Lechero osjeća ugroženim zbog Scofieldove “slave”. Lincoln pokušava pravnim sredstvima da prebaci Michaela i dobije poziv od rođaka. Oba dobijaju istu poruku, preko različitih kanala, od Kompanije.
Nakon što je Michael Scofield doveden u Sonu zbog smrti Villiama Kima, Michael otkriva da Kompanija ima Saru Tancredi . Kasnije otkriva informacije od svog brata, Lincolna Burrovsa, da mora da izbaci Jamesa Whistlera. Michael mora da prebaci Whistlera kao deo razmene talaca da bi spasio LJ od Kompanije.
Prison Break 